Químico y minerólogo guipuzcuano, hijo de Francisco Javier María de Munibe e Idiáquez, X Conde de Peñaflorida y fundador de la Sociedad de Amigos del País en Guipúzcoa y del Seminario Patriótico de Vergara. Adquirió una formación casi enciclopédica, formado en Vergara, en los cursos de química de Rouelle en París, en la Universidad sueca de Uppsala y en la Escuela de Minas de Freiberg, donde posteriormente estudiarían los hermanos Delhuyar. Visitó otras ciudades europeas, remitiendo desde cada una de ellas informes, croquis y descripciones de procesos metalúrgicos a la Sociedad Vascongada. Estos fueron publicados parcialmente en los <i>Extractos de las Juntas Generales</i> de la Sociedad y se consideraban de vital importancia para sacar a flote la industria férrea vasca. Fue miembro de la Real Sociedad de Ciencias de Suecia y del Instituto de Freiberg, y Secretario de la Sociedad Vascongada, donde parece probable que participase en los estudios sobre el platino. Tradujo el <i>Ensayo de Mineralogía</i> de Axel F. Cronstedt (1758). Su pronta muerte truncó la brillante carrera que llevaba.