La Universidad de Sigüenza tiene su origen en el Colegio San Antonio Portaceli, fundado en 1476 junto al monasterio de jerónimos extramuros de Sigúenza por Juan López de Medina, arcediano de Almazán, en colaboración con el obispo <a href='http://es.wikipedia.org/wiki/Pedro_Gonz%C3%A1lez_de_Mendoza'>D. Pedro González de Mendoza</a>, gran cardenal de España, y apoyado por el entonces vicario general del obispado, y después cardenal, <a href='http://es.wikipedia.org/wiki/Francisco_Jim%C3%A9nez_de_Cisneros'>Francisco Jiménez de Cisneros</a>. Al serle reconocida por el papa <a href='http://es.wikipedia.org/wiki/Inocencio_VIII'>Inocencio VIII</a> en su bula de 30 de abril de 1489 la facultad de conferir grados, se convierte en Universidad, conforme al modelo habitual en el Renacimiento española de Colegio-Universidad. La Universidad de Sigüenza estaba dotada con cátedras de Artes, Teología, Derecho canónico, y Medicina. La reforma del <a href='http://es.wikipedia.org/wiki/Jos%C3%A9_Antonio_Caballero'>Marqués de Caballero</a> de 1807 suprime un gran número de universidades menores, entre ellas la de Sigüenza, pero este plan queda sin efecto ante la invasión napoleónica. En 1824, el Colegio San Antonio Portaceli se incorpora a la <a href='http://www.uah.es'>Universidad de Alcalá</a> hasta su definitiva supresión con ésta en 1836. De 1836 a 1845 algunos edificios se utilizaron como viviendas, hasta que por R.O. de 14 de noviembre de 1845 se dispuso la incautación de todos los inmuebles universitarios que eran propiedad de la Iglesia.